毛璩只是派人往江陵送个死人，想不到竟意外斩获了桓玄，瞬间成了举国的焦点，此时他的运气着实让旁人分外眼红，但不久便霉运当头了。
毛祜之一行人抵达江陵，把被遗弃的司马德宗重新扶立为帝，毛璩的另一个侄子毛修之自任骁骑将军，好不威风。
刘毅等人在峥嵘洲大胜之后，认为大势已定，便没有乘胜追击，恰恰遇到西风，舰队无法前进，所以桓玄死后已经十天，各军还没有抵达江陵，而桓谦藏在沮中，扬武将军桓振藏在华容浦，暗中有了别的打算。
桓玄的旧部王稚徽，正在巴陵驻防，派人报告桓振说：“桓歆已攻克京口，冯稚已攻克寻阳，刘毅各军，都在中途溃败，上天注定大楚要振兴了。”
桓振大喜过望，迅速集结党羽二百人，袭击了江陵，桓谦很快也起兵响应。
闰5月3日，两人攻陷江陵，桓振到骑马闯进司马德宗的行宫，飞舞长矛，大声问：“桓升在哪里？”
此时巴蜀的军队早已闻风而逃，司马德宗哪能明白这种事，就算明白也说不出来，身边的人悄悄告诉桓振，桓升已经遇害。
“我们桓家有什么地方对不起晋国，而竟被屠灭成这个样子！连几岁的小娃都不放过！”桓振顿时情绪失控，准备要杀了司马德宗，以解心头之恨。
他固然感觉委屈，却丝毫没有意识到桓玄对司马家族做了什么事，一报还一报，只是时间来得太快了。
琅邪王司马德文一直在旁侍奉老哥，赶紧挡到前面解释说：“处死桓升，岂是我们兄弟的意思？”
桓谦也苦苦劝止，桓振才勉强下马，怒气稍为平息，几天后发布了桓玄的死讯，举行哀悼仪式，定桓玄的谥号为武悼皇帝。
闰5月7日，桓谦与桓振思量一番，终于下定决心，率领文武百官把玉玺还给安帝司马德宗，一脸恭敬地说：“陛下本有尧舜之德，而今楚国福分终结，民心复归大晋。”
司马德宗一脸木然地盯着玉玺，感觉很这东西何其眼熟，却始终想不到哪里见过了。
东晋虽然得以延续，但在江陵，桓振和桓谦才是真正作主的人，联合以司马德宗的名义下诏任命琅邪王司马德文，兼任徐州督导官，桓振为八郡军区司令长官、兼荆州督导官，桓谦官复原职，即高级咨询官、首都卫戍司令官，并再加授江豫两州督导官。
桓振从小就是一个品行不端的少年，桓玄从不把他当作自己的侄子，态度十分冷漠，但如今反倒是他收拾桓玄的残局，有次对身边的人发牢骚说：“叔叔从前就是因为不能早一点重用我，才使大局溃败成如此，如果叔叔仍在，我担任先锋司令，天下很容易平定，可惜现在我势单力孤，哪里才是归宿啊！”
既然回天乏术，桓振索性破缺罐子破摔，拼命饮酒、玩弄女性，肆无忌惮地疯狂杀戮，桓谦劝他带着皇帝率军东下，而由自己镇守江陵，也许还有当年曹操挟天子以令诸侯的际遇，但桓振一向瞧不起桓谦，拒绝接受。
即便桓振拥立司马德宗复位，勤王军仍未放弃剿灭桓氏家族，西征军统帅、冠军将军刘毅，进抵巴陵，斩了王稚徽，何无忌和刘道规，进攻桓谦驻守的马头和桓蔚驻守的龙泉，也全都击破。
何无忌打算乘胜直指江陵，刘道规劝他：“兵法中说顺利和不顺利都有一定条件，不可以心存侥幸，桓家几代下来，住在故楚西部，人民对他们效忠，已成习惯，桓振勇冠三军，很难在战场上夺取胜利，应该养精蓄锐，慢慢用计谋制服他，不怕不能攻克。”
何无忌不肯接受，与桓振在灵溪展开战，勤王军果然大败而回，退守寻阳，桓振则受到鼓舞，任命桓蔚为雍州督导官，镇守襄阳，决心与刘裕一决雌雄。
败讯传到下游，刘裕因为刘毅是统帅的缘故，暂时免除了刘毅青州督导官的职务。
6月，益州督导官毛璩终于也出手了，派将领攻击汉中，斩了桓玄任命的梁州督导官桓希，然后自兼梁州督导官。
身为勤王军首领的镇军将军刘裕，搞这些兼职就便利得多，随随便便就混了个青州督导官的职务。
他们各自得意悠闲的时候，勤王军西征大军则还在与桓振血拼。
晋陵郡长刘敬宣率军驻防寻阳，聚集粮秣，修建船舰，后勤工作做得十分完善，所以何无忌虽然吃了败仗，并没有一败不可收拾，很快就重振军威，向敌人发起新一轮的猛攻。
桓玄的侄子桓亮自称江州督导官，试探性地攻击豫章，被刘敬宣击退，刘毅、何无忌、刘道规，则再度从寻阳出发，驻军夏口。
荆州督导官桓振也进入状态，派镇东将军冯该，据守长江东岸，扬武将军孟山图，据守鲁山城，辅国将军桓仙客，据守偃月垒，军队共有一万人，水陆呼应。
双方兵力人数并没有太大差别，但勤王军士气高昂，交战之后，实际差别迅速突显，刘毅攻击鲁山城，刘道规攻击偃月垒，何无忌则监视长江中游，三人分工明确，从早晨激战到中午，鲁山城和偃月垒相继崩溃，孟山图和桓仙客遭生擒，冯该逃奔石城，被追军击杀。
至此桓振的声势彻底被攻陷，苟延残喘了几个月，于次年正月，挟持安帝司马德宗，出江陵城，进驻江津，派使节晋见刘毅，表示愿意把安帝送还，但条件是割让荆江二州，并保证桓家人的人身安全。
刘毅果断拒绝了这一异想天开的提议，继续率军攻打，一路势如破竹，直逼江陵城，桓谦心胆俱裂，直接弃城逃奔后秦，部属卞范之等人，全被刘毅斩首。
看着江陵城上空火光冲天，桓振意识到城池已经沦陷，瞬间没了指望，仓惶逃往涢川，不久又集结残余部众准备偷袭城池，被刘毅的将领斩杀。
讨伐桓玄虽是刘裕发起的，但真正平定桓玄的却是刘毅，刘裕通过镇压孙恩之乱而声名雀起，刘毅也因为消灭桓玄并为司马家族复位而声威日增，再加上一个刘穆之，东晋末年的朝局终于被三刘左右。
益州的毛璩当然心有不甘，毕竟他才是第一个公然反对桓玄的人，而且桓玄的人头也是他的人砍的，然而也就是这股争强好胜的劲头，把他推向了毁灭。
(本章完)